《奇幻贵公子》围绕女高中生谷山麻衣展开，她拥有能看见幽灵的能力。在一次学校出现灵异现象后，麻衣结识了涉谷一也，也就是拥有超能力的“贵公子”。涉谷一也经营着一家专门解决灵异事件的公司，麻衣自此加入其中，和团队一起应对各种超自然现象。团队里还有和尚林兴徐、巫女松崎绫子等性格各异的成员。他们遇到过被怨灵纠缠的古老宅邸，宅中物品莫名移动、奇怪声响不断；也处理过学校闹鬼事件，学生们接连遭遇诡异之事。在一次次冒险中，众人凭借各自的能力揭开灵异事件背后的真相，同时也逐渐加深了彼此的信任和感情。