《X 战警：进化第一季》围绕一群年轻变种人展开。在泽维尔天才少年学校里，有斯科特、琴·格雷、洛根等大家熟知的角色，还有新加入的年轻变种人如朱比莉、冰人鲍比等。他们一边要学习控制自身刚觉醒的超能力，一边还要应对外界对变种人的恐惧与敌意。学校外，邪恶变种人兄弟会不断制造麻烦，他们企图通过极端手段让变种人统治人类。在一次兄弟会抢夺危险武器的行动中，X 战警们挺身而出阻止，年轻的变种人在战斗中逐渐成长。同时，学校内部也存在着矛盾与挑战，学生们在友情、爱情和自我认同上不断探索，在一次次危机中，他们逐渐凝聚成一个强大的团队，共同守护变种人与人类和平共处的未来。