《森林战士》围绕少女玛丽·凯瑟琳展开。她原本是个科学少女，因母亲病重，随父亲回到森林。母亲去世后，她意外发现森林里存在一个神秘的微观世界，这里生活着森林战士，他们守护着森林的平衡，对抗着邪恶势力波格和他的爪牙。玛丽被一股神秘力量缩小，卷入这场战斗。她结识了森林战士罗南、小精灵葛洛特等伙伴。在与邪恶势力的对抗中，玛丽逐渐成长，和伙伴们并肩作战。最终，他们成功击败波格，拯救了森林，玛丽也回到了正常世界，但这段奇妙的经历让她对自然有了全新的认识。