《我们仍未知道那天所看见的花的名字剧场版》延续了TV版的故事，仁太、安鸣、雪集、鹤见、波波等超和平busters的成员们，在面码成功转世后，生活逐渐回归正轨。然而，面码的离去让大家心中仍留有遗憾与思念。一天，仁太收到了面码的信，信中提及大家曾一起许下的愿望。这封信打破了表面的平静，让成员们再次聚到一起。他们开始重新探寻曾经的回忆，在这个过程中，那些被隐藏的情感与矛盾逐渐浮现。有人因过去的误会心生隔阂，有人在面对回忆时陷入迷茫。但最终，他们在彼此的理解与包容中，解开了心结，也真正放下了过去的遗憾，带着对未来的期许，继续前行。