《契约之吻》的故事围绕着神秘组织“索伦”展开。高中生波多野晴人表面平凡，实则身负巨债，为了偿还债务，他加入“索伦”成为一名杀手。在执行任务过程中，晴人与神秘美女七濑葵签订了特殊契约，共同完成危险任务。七濑葵性格傲娇，实力强大，与晴人在合作中逐渐产生复杂情感。随着任务推进，他们发现“索伦”背后隐藏着巨大阴谋，组织内部权力斗争激烈，各方势力暗流涌动。晴人与葵在一次次生死考验中，不仅要应对外部敌人，还要处理彼此之间微妙的感情，他们能否揭开阴谋真相，在危机四伏的世界中生存下去，成为故事的一大看点。