《怪兽大战外星人外传：活死人萝卜之夜》的故事发生在一个充满奇幻色彩的世界。苏珊、独眼巨人、昆虫博士等一群拥有特殊能力的怪兽们生活在一个秘密基地。某一天，小镇上突然出现了危机，邪恶的活死人萝卜开始肆虐。这些活死人萝卜不仅数量众多，而且拥有强大的破坏力，所到之处一片狼藉。怪兽们得知消息后，迅速行动起来。苏珊凭借自己巨大的身躯和力量，与活死人萝卜展开正面交锋；独眼巨人利用自己的特殊视力，寻找活死人萝卜的弱点；昆虫博士则发挥自己的智慧，研制对抗活死人萝卜的武器。在战斗过程中，怪兽们遭遇了重重困难，但他们始终没有放弃，最终成功击退了活死人萝卜，拯救了小镇。